口袋妖怪火红完整通行全部七岛的彩虹通行证，需要先完成一周目主线、解锁全国图鉴、获取三岛通行证并完成一之岛红宝石支线任务后，从一之岛精灵中心的研究员阿锦手中领取，该道具是自由往返四至七岛的核心关键道具，缺少该道具仅能进入一、二、三岛，无法解锁剩余岛屿的神兽、秘传机与火箭队剧情。
解锁彩虹通行证的前置流程需要分步完成多重硬性条件，第一步要通关红莲岛道馆击败馆主夏伯，走出道馆后会遇见等候在此的正辉，对话后即可获得三岛通行证，持有该道具能从枯叶市码头搭乘渡轮往返前三座岛屿，此时可提前前往一之岛熟悉地图布局，为后续寻找红宝石节省赶路时间；第二步需要完成联盟挑战，击败四天王与冠军完成名人堂记录，回到真新镇和大木博士对话，只有图鉴内捕获宝可梦种类达到六十种及以上，博士才会将关都图鉴升级为全国图鉴，未达成捕获数量标准则无法触发后续七岛进阶剧情，不少玩家会卡在这一步，建议提前在关都各道路、洞穴收集不同种类宝可梦，避免后期重复刷怪。
完成图鉴升级后前往枯叶市港口坐船重返一之岛，精灵中心右侧存在一台大型通讯设备，站在设备旁的研究员阿锦会主动对话，告知设备缺少红宝石无法完成跨地区通讯，随即开启寻找红宝石的支线任务，出发前队伍内必须携带掌握怪力技能的宝可梦，灯火山内部存在大量可推动岩石解谜路段，缺少怪力会无法抵达红宝石拾取点位，从一之岛北侧使用冲浪抵达灯火山入口，沿路清理沿途训练师与野生宝可梦，逐层推进洞穴深处，在最内层岩石后方的地面格子里就能拾取红色宝石道具，途中会遭遇火箭队杂兵阻拦，提前备好回复道具与克制地面、火系宝可梦的对战阵容能大幅降低通关难度。
拿到红宝石后原路返回一之岛精灵中心，将红宝石交付给阿锦，在完成简短剧情对话后，道具栏的重要物品栏会新增彩虹通行证，持有该道具后码头渡轮会解锁全部七座岛屿航线，可自由往返四、五、六、七岛，同时阿锦会追加寻找蓝宝石的长线任务，蓝宝石藏于六之岛点之穴深处，后续集齐两块宝石还能解锁华蓝洞超梦捕捉区域；额外补充实用玩法细节，若中途丢失三岛通行证无需重复找正辉对话，直接前往枯叶市码头船员处对话即可补发，七岛各岛屿分布培育屋、对战塔、未知图腾遗迹、冻瀑洞窟等专属场景，四之岛洞窟内可获取秘传机攀瀑，五之岛存在火箭队仓库，需要收集两组密码才能开门，六、七岛藏有大量稀有野生宝可梦与隐藏道具，拿到彩虹通行证后可一次性完成全岛屿探索，不用分段往返关都地区补给。
